前者以 [γ-32P] ATP為phosphate donor，利用T4 polynucleotide kinase的活性對(duì)帶有5’-OH的DNA進(jìn)行標(biāo)定。人工合成的寡核苷酸 （oligonucleotides） 5’端為-OH group，可直接用于kinase reaction；一般DNA片段，若5’端帶有phosphate group，先經(jīng)phosphatase處理，再進(jìn)行kinase reaction。 Filling-in reaction是將DNA以特定限制酶切開，露出recessed 3’ termini后，利用Klenow的活性把3’端補(bǔ)齊 （filling-in）；因此，只要加入適當(dāng)?shù)?[α-32P] dNTP，即可在DNA的3’端進(jìn)行標(biāo)定。

 

    此外，也可以應(yīng)用bacteriophage T4 DNA polymerase 的3’→5’ exonuclease 活性制造recessed 3’termini，再進(jìn)行filling-in。 至于正意股或反意股RNA探針，則可以 [α-32P] UTP或DIG-11-UTP等為標(biāo)定物質(zhì)，應(yīng)用胞外轉(zhuǎn)錄反應(yīng)加以標(biāo)定。 下面要介紹的是目前zui常用的方法：random priming及PCR。